Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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