Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prdm5Q9CXE0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prdm5Q9CXE0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prdm5Q9CXE0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Prdm5Q9CXE0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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