Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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