Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pin4Q9CWW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pin4Q9CWW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms