Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Fcf1Q9CTH6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fcf1Q9CTH6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fcf1Q9CTH6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms