Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pard3bQ9CSB4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms