Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q9CQM1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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