Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms