Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms