Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpa3Q9CQ71 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpa3Q9CQ71 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms