Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms