Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh23Q99PF4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh23Q99PF4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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