Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem2Q99NH8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms