Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms