Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms