Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ms4a6dQ99N07 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ms4a6dQ99N07 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ms4a6dQ99N07 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6dQ99N07 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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