Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms