Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms