Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms