Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Msi2Q920Q6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms