Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm2Q91YD4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms