Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims2Q91XD2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms