Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms