Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsndQ8VIM4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsndQ8VIM4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms