Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rprd1aQ8VDS4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms