Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TgdsQ8VDR7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgdsQ8VDR7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms