Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms