Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml1Q8K558 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms