Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms