Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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