Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufs8Q8K3J1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs8Q8K3J1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms