Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf39Q8K2Z2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms