Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d5Q8JZW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms