Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms