Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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