Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tshz3Q8CGV9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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