Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bola3Q8CEI1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bola3Q8CEI1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms