Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms