Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms