Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms