Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A430089I19RikQ8C9W1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms