Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms