Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms