Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trub1Q8C0D0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms