Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iffo1Q8BXL9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms