Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp5Q8BX09 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms