Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Usp38Q8BW70 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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