Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp4aQ8BU40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms