Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup54Q8BTS4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms