Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BP99 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BP99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BP99 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BP99 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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